Pierre Aubry a débuté son apprentissage musical auprès de Françoise Métrope à l’âge de 7 ans, et 5 ans plus tard l’orgue auprès d’Yves Hillion puis Michel Dubois alors cotitulaires des grandes orgues de la cathédrale de Saint Brieuc. En parallèle à ses études d’ingénieur à l’école des Mines de Nantes, il obtient en 2005 le brevet supérieur du concours national d’orgue Marcel Dupré de Chartres. Quelques années plus tard, il se perfectionne à l’Académie de Arts Sacrés de Saint Vincent à Rennes auprès de Jean-René André, cotitulaire des grandes orgues de la cathédrale de Rennes.